立体显微镜在运用前的调校主要有：调焦，视度调理，瞳距调理和灯泡替换几个过程。下面别离进行阐明。调焦：将工作台板放入底座上的台板安装孔内。调查透明标本时，选用毛玻璃台板，调查不透明标本时，选用是非台板。然后松开调焦滑座上的紧固螺钉，调理镜体的高度，使其与所选用的物镜放大倍数大体共同的工作间隔。调好后，须锁紧紧固螺钉。调焦时，建议选用平面物体，如印有字符的平整纸张、直尺、三角板等。
视度调理：先将左右目镜筒上的视度圈均调至0刻线方位。通常情况下，先从右目镜筒中调查。将变倍手轮转至*低倍方位，转动调焦手轮和视度调理圈对标本进行调理，直至标本的图画明晰后，再把变倍手轮转至*高倍方位继续进行调理直到标本的图画明晰停止，此刻，用左目镜筒调查，如不明晰则沿轴向调理左目镜筒上的视度圈，直到标本的图画明晰停止。瞳距调理：扳动两目镜筒，可以改动两目镜筒的出瞳间隔。当运用者调查视场中的两个圆形视场彻底重合时，阐明瞳距已调理好。
立体显微镜应该注意的是因为个别的视力及眼睛的调理差异，因而，不同的运用者或即便是同一运用者在不同时间运用同一台显微镜时，应别离进行齐焦调整，以便取得*佳的调查效果。无论是替换上光源灯泡，仍是替换下光源灯泡，在替换前，请务必将电源开关关上，电源线插头一定要从电源插座上拔下。当替换上光源灯泡时，先拧出上光源灯箱的滚花螺钉，取下灯箱，然后从灯座上卸下坏灯泡，换上好灯泡，再把灯箱和滚花螺钉装上即可。当替换下光源灯泡时，需将毛玻璃台板或是非台板，从底座上取出，然后从灯座上取下坏灯泡，换上好灯泡;再把毛玻璃台板或是非台板装好即可。替换灯泡时，请用洁净的软布或棉纱将灯泡玻壳擦洗洁净，以保证照明效果。
立体显微镜运用方法
1、装好显微镜后，在保证供电电压与显微镜的额外电压共同后方可插上电源插头，翻开电源开关，并选择照明方法;
2、根据所调查的标本，选好台板，装入底座台板孔内，并锁紧。
3、松开调焦滑座上的紧固螺钉，调理镜体的高度，目测工作间隔在80mm左右，调好后，锁紧托架，将安全环紧靠调焦托架并锁紧。
4、装好目镜，先将目镜筒上的螺钉松开，装好目镜后再将此螺钉拧紧。
5、调好瞳距，当运用者通过两个目镜调查视场时中不是一个圆形视场时，应扳动两棱镜箱，改动目镜筒的出瞳间隔，使之达到能调查到一个彻底重合的圆形视场。
6、立体显微镜调查标本。 先将左目镜筒上的视度圈调至0刻线方位。通常情况下，先从右目镜筒中调查，将变倍筒转至*高倍方位，转动调焦手轮对标本调焦，直至标本的像明晰后，再把变倍筒转至*低倍方位，此刻，用左目镜筒调查，如不明晰则沿轴向调理目镜筒上的视度圈，直到标本的像明晰，然后再双目调查其调焦效果。
7、完毕调查时，关掉电源，移走标本，用防尘罩将显微镜紧密罩盖。
