1、要养成两眼同时睁开观察的习惯，以左眼观察视野，右眼用以绘图。
2、水滴、酒精或其它药品切勿触摸镜头和镜台，假如沾污应立即用擦镜纸擦净。
3、不要随意取下目镜，以避免尘土落入物镜，也不要恣意拆卸各种零件，以防损坏。
4、放置玻片标本时要对准通光孔中心，且不能反放玻片，避免压坏玻片或碰坏物镜。
5、轻拿轻放，不可把显微镜放置在实验台的边际，应放在距边际10cm处，避免碰翻落地。
6、持镜时有必要是右手握臂、左手托座的姿势，不可单手提取，避免零件脱落或碰撞到其它当地。
7、保持显微镜的清洁，光学和照明部分只能用擦镜纸擦拭，切忌口吹手抹或用布擦，机械部分用布擦拭。
8、运用结束后，有必要复原才能放回镜箱内，其过程是：取下标本片，滚动旋转器使镜头离注册光孔，下降镜台，平放反光镜，下降集光器(但不要触摸反光镜)、关闭光圈，推片器回位，盖上绸布和外罩，放回实验台柜内。最终填写运用登记表。(注：反光镜一般应笔直放，但有时因集光器没提至应有高度，镜台下降时会碰坏光圈，所以这里改为平放)
